Tus imágenes de microscopía, centralizadas y compartidas
Una plataforma de gestión de imágenes científicas impulsada por OMERO, instalada y mantenida por DINAO. Centraliza, anota y comparte tus datos de microscopía — en servidores franceses, conformes al RGPD.
¿Qué es OMERO?
OMERO (OME Remote Objects) es la plataforma open source de gestión de imágenes de microscopía desarrollada por el consorcio Open Microscopy Environment (OME). Permite importar, almacenar, organizar, visualizar y compartir imágenes científicas y sus metadatos, independientemente de su procedencia, desde un servidor central accesible por la web o mediante clientes dedicados.
Gracias a la biblioteca Bio-Formats, OMERO lee más de 150 formatos propietarios (Zeiss .czi, Leica .lif…) y los hace interoperables mediante los estándares abiertos OME-TIFF y OME-Zarr. Las imágenes se organizan en proyectos, conjuntos de datos y pantallas, con etiquetas, anotaciones, regiones de interés y medidas indexadas y buscables.
El ecosistema incluye clientes y módulos potentes : OMERO.web para la navegación, OMERO.iviewer para la visualización multidimensional, OMERO.figure para componer figuras de publicación, así como una API Python e integraciones con ImageJ/Fiji, QuPath y CellProfiler. OMERO gestiona grupos, roles y permisos finos, ideal para plataformas de imagen compartida.
Aloja OMERO en DINAO
Niveles de recursos compatibles con los requisitos de OMERO (mínimo 2 vCPU / 4096 Mo / 30 Go). Alojado en Francia, gestionado.
- 2 vCPU dedicados
- 4 Go de RAM
- 40 Go NVMe
- Copias de seguridad diarias
- Gestionado y supervisado por DINAO
- 4 vCPU dedicados
- 8 Go de RAM
- 80 Go NVMe
- Copias de seguridad diarias
- Gestionado y supervisado por DINAO
- 8 vCPU dedicados
- 16 Go de RAM
- 160 Go NVMe
- Copias de seguridad diarias
- Gestionado y supervisado por DINAO
1 nivel(es) oculto(s) (recursos insuficientes para esta app) : Découverte
Detalles técnicos
Te preguntas…
¿Qué formatos de imágenes admite OMERO?
Gracias a Bio-Formats, OMERO lee más de 150 formatos propietarios de microscopía (Zeiss .czi, Leica .lif, Nikon, Olympus…) y los expone en formatos abiertos como OME-TIFF y OME-Zarr, sin conversión manual.
¿Puedo conectar ImageJ, Fiji o QuPath?
Sí. OMERO dispone de plugins y una API Python que permiten acceder a las imágenes desde ImageJ/Fiji, QuPath, CellProfiler y tus propios scripts de análisis, sin duplicar los archivos.
¿Cómo compartir imágenes con mis colegas?
OMERO gestiona grupos y permisos finos. Compartes proyectos y conjuntos de datos dentro de tu equipo, o generas enlaces públicos de solo lectura para acompañar una publicación científica.
¿Dónde se alojan mis datos científicos?
En la infraestructura DINAO en Francia, en uno de los centros de datos disponibles. Tus imágenes y metadatos no salen del territorio, conforme al RGPD.
¿El almacenamiento es escalable?
Sí. El volumen de imagen comienza según tu fórmula y se expande a demanda a medida que crecen tus adquisiciones, sin migración ni interrupción del servicio.
