Ihre Mikroskopiebilder, zentralisiert und geteilt
Eine Plattform zur Wissenschaftlichen Bildverwaltung angetrieben von OMERO, installiert und gewartet von DINAO. Zentralisieren, annotieren und teilen Sie Ihre Mikroskopiedaten — auf französischen Servern, DSGVO-konform.
Was ist OMERO?
OMERO (OME Remote Objects) ist die Open-Source-Plattform zur Verwaltung von Mikroskopiebildern, entwickelt vom Konsortium Open Microscopy Environment (OME). Sie ermöglicht das Importieren, Speichern, Organisieren, Anzeigen und Teilen wissenschaftlicher Bilder und ihrer Metadaten, unabhängig von ihrer Herkunft, über einen zentralen Server, der über das Web oder dedizierte Clients zugänglich ist.
Dank der Bibliothek Bio-Formats liest OMERO mehr als 150 proprietäre Formate (Zeiss .czi, Leica .lif…) und macht sie über die offenen Standards OME-TIFF und OME-Zarr interoperabel. Bilder werden in Projekten, Datasets und Screens organisiert, mit indexierten und durchsuchbaren Tags, Annotationen, Regionen von Interesse und Messungen.
Das Ökosystem umfasst leistungsstarke Clients und Module: OMERO.web für die Navigation, OMERO.iviewer für die multidimensionale Visualisierung, OMERO.figure zum Erstellen von Publikationsfiguren sowie eine Python-API und Integrationen mit ImageJ/Fiji, QuPath und CellProfiler. OMERO verwaltet Gruppen, Rollen und feine Berechtigungen, ideal für geteilte Imaging-Plattformen.
Hosten Sie OMERO bei DINAO
Ressourcenstufen kompatibel mit den Anforderungen von OMERO (min. 2 vCPU / 4096 Mo / 30 Go). In Frankreich gehostet, vollständig gemanagt.
- 2 dedizierte vCPUs
- 4 Go RAM
- 40 GB NVMe
- Tägliche Backups
- Gemanagt & überwacht von DINAO
- 4 dedizierte vCPUs
- 8 Go RAM
- 80 GB NVMe
- Tägliche Backups
- Gemanagt & überwacht von DINAO
- 8 dedizierte vCPUs
- 16 Go RAM
- 160 GB NVMe
- Tägliche Backups
- Gemanagt & überwacht von DINAO
1 verborgene Stufe(n) (unzureichende Ressourcen für diese App) : Découverte
Technische Details
Sie fragen sich…
Welche Bildformate unterstützt OMERO?
Dank Bio-Formats liest OMERO mehr als 150 proprietäre Mikroskopieformate (Zeiss .czi, Leica .lif, Nikon, Olympus…) und stellt sie in offenen Formaten wie OME-TIFF und OME-Zarr bereit, ohne manuelle Konvertierung.
Kann ich ImageJ, Fiji oder QuPath verbinden?
Ja. OMERO verfügt über Plugins und eine Python-API, die den Zugriff auf Bilder aus ImageJ/Fiji, QuPath, CellProfiler und Ihren eigenen Analyse-Skripten ermöglichen, ohne die Dateien zu duplizieren.
Wie teile ich Bilder mit meinen Kollegen?
OMERO verwaltet Gruppen und feine Berechtigungen. Sie teilen Projekte und Datasets innerhalb Ihres Teams oder generieren öffentliche schreibgeschützte Links, um eine wissenschaftliche Publikation zu begleiten.
Wo werden meine wissenschaftlichen Daten gehostet?
Auf der DINAO-Infrastruktur in Frankreich, in einem der verfügbaren Rechenzentren. Ihre Bilder und Metadaten verlassen nicht das Hoheitsgebiet, gemäß der DSGVO.
Ist der Speicher erweiterbar?
Ja. Das Bildspeichervolumen startet je nach Ihrem Tarif und wächst bedarfsgerecht mit Ihren Erhebungen, ohne Migration oder Dienstunterbrechung.
