Le tue immagini di microscopia, centralizzate e condivise
Una piattaforma di gestione di immagini scientifiche alimentata da OMERO, installata e mantenuta da DINAO. Centralizza, annota e condividi i tuoi dati di microscopia — su server francesi, conformi al RGPD.
Cos'è OMERO ?
OMERO (OME Remote Objects) è la piattaforma open source per la gestione di immagini di microscopia sviluppata dal consorzio Open Microscopy Environment (OME). Consente di importare, archiviare, organizzare, visualizzare e condividere immagini scientifiche e i relativi metadati, indipendentemente dalla loro provenienza, tramite un server centrale accessibile via web o tramite client dedicati.
Grazie alla libreria Bio-Formats, OMERO legge oltre 150 formati proprietari (Zeiss .czi, Leica .lif…) e li rende interoperabili tramite gli standard aperti OME-TIFF e OME-Zarr. Le immagini si organizzano in progetti, dataset e schermate, con tag, annotazioni, regioni di interesse e misure indicizzate e ricercabili.
L'ecosistema include client e moduli potenti : OMERO.web per la navigazione, OMERO.iviewer per la visualizzazione multidimensionale, OMERO.figure per comporre figure per la pubblicazione, nonché un'API Python e integrazioni con ImageJ/Fiji, QuPath e CellProfiler. OMERO gestisce gruppi, ruoli e permessi granulari, ideale per piattaforme di imaging condivise.
Alloggia OMERO su DINAO
Livelli di risorse compatibili con i requisiti di OMERO (2 vCPU / 4096 Mo / 30 Go minimo). Ospitato in Francia, fully managed.
- 2 vCPU dedicati
- 4 Go di RAM
- 40 Go NVMe
- Backup quotidiani
- Fully managed & supervisionato da DINAO
- 4 vCPU dedicati
- 8 Go di RAM
- 80 Go NVMe
- Backup quotidiani
- Fully managed & supervisionato da DINAO
- 8 vCPU dedicati
- 16 Go di RAM
- 160 Go NVMe
- Backup quotidiani
- Fully managed & supervisionato da DINAO
1 livello/i nascosto/i (risorse insufficienti per questa app) : Découverte
Dettagli tecnici
Ti chiedi…
Quali formati di immagini supporta OMERO?
Grazie a Bio-Formats, OMERO legge oltre 150 formati di microscopia proprietari (Zeiss .czi, Leica .lif, Nikon, Olympus…) e li espone in formati aperti come OME-TIFF e OME-Zarr, senza conversione manuale.
Posso collegare ImageJ, Fiji o QuPath?
Sì. OMERO dispone di plugin e di un'API Python che permettono di accedere alle immagini da ImageJ/Fiji, QuPath, CellProfiler e dai tuoi script di analisi personalizzati, senza duplicare i file.
Come condividere le immagini con i miei colleghi?
OMERO gestisce gruppi e permessi granulari. Condividi progetti e dataset all'interno del tuo team, o genera link pubblici di sola lettura per accompagnare una pubblicazione scientifica.
Dove sono ospitati i miei dati scientifici?
Sull'infrastruttura DINAO in Francia, in uno dei datacenter disponibili. Le tue immagini e i metadati non lasciano il territorio, conformemente al RGPD.
L'archiviazione è espandibile?
Sì. Il volume immagine parte in base alla tua formula e si espande su richiesta man mano che le tue acquisizioni crescono, senza migrazione né interruzione del servizio.
